Todos los entrenadores de Atlético Rafaela en la era profesional

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– 1989/90: Horacio Bongiovanni.

– 1990/91: Horacio Bongiovanni.

– 1991/92: Horacio Bongiovanni (hasta fecha 21); Francisco Calabrese (hasta final).

– 1992/93: Francisco Calabrese (hasta fecha 8); Gustavo Alfaro- Omar Racca (hasta fecha 12); Roberto Rogel (hasta el final). 

– 1993/94: Carlos Biasutto (hasta fecha 26); Gustavo Alfaro-Omar Racca (hasta el final).

– 1994/95: Gustavo Alfaro-Víctor Bottaniz.

– 1995/96: Gustavo Alfaro-Víctor Bottaniz (hasta fecha 13 del Clausura). Víctor Bottaniz (hasta el final).

– 1996/97: Ángel Bargas (hasta fecha 13 de Zona Campeonato); Sergio Podio (hasta final).

– 1997/98: Sergio Podio (hasta fecha 7); Víctor Bottaniz (hasta fecha 12); Jorge Ghiso (hasta el final).

– 1998/99: Gustavo Alfaro.

– 1999/00: Gustavo Alfaro.

– 2000/01: Gustavo Alfaro (hasta fecha 21); Jorge Ginarte (hasta el final).

– 2001/02: Jorge Ghiso.

– 2002/03: Oscar Blanco.

– 2003/04: Oscar Blanco (hasta fecha 13); Alejandro Zurbriggen (fecha 14); Osvaldo Piazza (hasta el final).

– 2004/05: José Luis Brown (hasta fecha 11 del Clausura); Jorge Ginarte (hasta el final).

– 2005/06: Jorge Ginarte (hasta fecha 11 del Apertura); José Restelli-Omar Racca (fechas 12,13 y 14); Oscar Garré (hasta el final).

– 2006/07: Jorge Ghiso.

– 2007/08: Juan Amador Sánchez.

– 2008/09: Carlos Marcelo Fuentes.

– 2009/10: Carlos Trullet.

– 2010/11: Carlos Trullet.

– 2011/12: Carlos Trullet (hasta fecha 5 del Clausura); Rubén Darío Forestello (hasta el final).

– 2012/13: Rubén Darío Forestello (hasta fecha 16 del Apertura); Víctor Bottaniz (fechas 17 y 18); Jorge Burruchaga (hasta el final).

– 2013/14: Jorge Burruchaga.

– 2014: Roberto Sensini.

– 2015: Roberto Sensini (hasta fecha 8); Gustavo Tognarelli (fecha 9); Leonardo Astrada (hasta el final).

– 2016: Jorge Burruchaga (hasta fecha 8).